Diagnostic de sols
Le Microbiote du Sol
Levier d’action face au changement climatique.
Le microbiote est une communauté de microorganismes qui cohabitent au sein d’un même environnement. Dans le sol, il forme un écosystème riche et complexe en constante interaction avec tous les éléments à proximité, dont les animaux et végétaux. Un gramme de sol abrite un milliard de bactéries, soit environ 1000 fois plus que de cellules de champignons. Ce milliard de cellules est loin d’être une masse homogène ; il constitue un écosystème varié et structuré, composé de bactéries spécialisées dans la réalisation de certaines fonctions et en interactions permanentes les unes avec les autres.
Les bactéries ont un rôle clé dans la réalisation des fonctions du sol et dans le maintien de sa santé. Le microbiote du sol a donc un impact direct sur les rendements et sur la qualité des productions agricoles.
Le microbiote du sol participe activement aux grandes fonctions du sol : rétention de l’eau, recyclage des nutriments, stockage du carbone, fixation de l’azote, régulation de la production de gaz à effets de serre, support de la biodiversité, structuration du sol, et régulation des contaminants. Il a ainsi un impact direct sur la résilience des sols et des cultures face aux aléas climatiques.
Les bactéries des sols sont impliquée dans chacune de ces fonctions. Elles sont donc essentielles au bon fonctionnement des sols et rendent de multiples services écosystémiques. Ainsi les bactéries des sols soutiennent la productivité des sols agricoles et la qualité des rendements. Cependant, la pratique de l’agriculture exerce un stress chronique sur cet écosystème fragile et abouti progressivement à son affaiblissement, voire à la perte de certaines espèces bactériennes qui portent des fonctions uniques : les espèces « keystones ».
Une connaissance approfondie du fonctionnement des communautés bactériennes des sols permet d’envisager des stratégies de restauration ciblée grâce aux espèces keystones.
90 % des bactéries du sol sont encore inconnues car elles n’ont jamais été cultivées. Cette méconnaissance entrave la compréhension du microbiote et de son fonctionnement global. STARFISH Bioscience lève le voile sur cette biodiversité microbienne en utilisant des technologies de séquençage ADN innovantes pour identifier et comprendre le fonctionnement des bactéries du sol.
Cette connaissance est le point de départ de la mise en place d’actions de régénération du microbiote du sol pour améliorer la santé du sol et enfin produire plus, produire mieux et produire de façon durable dans les conditions imposées par le changement climatique.
SERVICE DIAGNOSTIC
Connaissance à haute valeur ajoutée du microbiote de vos sols.
Notre service de diagnostic fonctionnel du microbiote du sol utilise des technologies de pointe basées sur le séquençage ADN à haute résolution des microorganismes des sols. Nous analysons ensuite ces données grâce à des outils bioinformatiques innovants développés par l’équipe R&D de STARFISH Bioscience afin de donner du sens à ces informations et d’en faire émerger des leviers d’action concrets.
cas d’usage
Biodiversité Microbienne
Contrairement aux autres méthodes d’analyse des communautés bactériennes des sols qui ne permettent qu’une description partielle des grandes familles de bactéries présentes, notre méthodologie d’analyse permet d’identifier avec précision chaque espèce rencontrée. La biodiversité bactérienne est ainsi révélée en détail. Les espèces bénéfiques et les pathogènes deviennent visibles.
Écosystème Fonctionnel Bactérien
Les outils innovants de bio-informatiques développés par STARFISH Bioscience permettent une approche totalement novatrice de l’étude du microbiote : nous reconstituons et analysons les fonctions bactériennes (rétention de l’eau, cycle du carbone, cycle de l’azote, etc.) présentes dans les microbiotes des sols.
Notre analyse reconstitue les relations fonctionnelles entre les bactéries à l’échelle de l’écosystème. Elle livre ainsi une compréhension systémique du fonctionnement du microbiote des sols et révèle les voies métaboliques potentiellement altérées. Ces informations uniques permettent de prendre des décisions fondées sur la mesure du potentiel fonctionnel de chaque sol.
Outil pour le Suivi de l’Impact des Pratiques Agricoles
La précision de notre analyse des microbiotes en fait un outil parfaitement adapté pour améliorer la connaissance de son sol. Notre approche sur-mesure croise les analyses du microbiote avec les mesures physico-chimiques faites sur ces sols ansi qu’avec les données de l’exploitant agricole (vigueur, rendement, carences, dépérissement, etc.) pour permettre des analyses et interprétations précises en réponse aux problèmes observées.